Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms