Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODC1P11926 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ODC1P11926 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODC1P11926 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms