Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms