Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms