Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms