Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF10O60809 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms