Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms