Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FABP7O15540 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FABP7O15540 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FABP7O15540 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms