Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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