Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms