Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms