Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GGTLC3B5MD39 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms