Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms