Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms