Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms