Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms