Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms