Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms