Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms