Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSD3Q9NYI0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms