Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXC10Q9NYD6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms