Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms