Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms