Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms