Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ASCL3Q9NQ33 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms