Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RAB18Q9NP72 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RAB18Q9NP72 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RAB18Q9NP72 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB18Q9NP72 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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