Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms