Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XAB2Q9HCS7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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