Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms