Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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AMBRA1Q9C0C7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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AMBRA1Q9C0C7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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AMBRA1Q9C0C7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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AMBRA1Q9C0C7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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AMBRA1Q9C0C7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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