Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4CQ9C0C4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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