Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms