Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms