Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms