Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2AFJQ9BTM1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms