Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TXNDC17Q9BRA2 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TXNDC17Q9BRA2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms