Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms