Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms