Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms