Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms