Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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RABGGTAQ92696 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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RABGGTAQ92696 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RABGGTAQ92696 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RABGGTAQ92696 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RABGGTAQ92696 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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