Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms