Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms