Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms