Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms