Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms