Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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