Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD6Q6ZSS7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD6Q6ZSS7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms