Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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ZBED9Q6R2W3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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