Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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LRRC38Q5VT99 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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LRRC38Q5VT99 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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LRRC38Q5VT99 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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LRRC38Q5VT99 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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LRRC38Q5VT99 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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LRRC38Q5VT99 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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LRRC38Q5VT99 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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LRRC38Q5VT99 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC38Q5VT99 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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